TITLE

Genomic regions determining resistance to leaf stripe (Pyrenophora graminea) in barley

AUTHOR(S)
Arru, L; Niks, R E; Lindhout, P; Valé, G; Francia, E; Pecchioni, N
PUB. DATE
June 2002
SOURCE
Genome;Jun2002, Vol. 45 Issue 3, p460
SOURCE TYPE
Academic Journal
DOC. TYPE
Article
ABSTRACT
Leaf stripe is a seed-borne disease of barley (Hordeum vulgare) caused by Pyrenophora graminea. Little is known about the genetics of resistance to this pathogen. In the present work, QTL analysis was applied on two recombinant inbred line (RIL) populations derived from two- and six-rowed barley genotypes with different levels of partial resistance to barley leaf stripe. Quantitative trait loci for partial resistance were identified using the composite interval mapping (CIM) method of PLABQTL software, using the putative QTL markers as cofactors. In the L94 × 'Vada' mapping population, one QTL for resistance was detected on chromosome 2H; the same location as the leaf-stripe resistance gene Rdg1 mapped earlier in 'Alf', where it confers complete resistance to the pathogen. An additional minor-effect QTL was identified by further analyses in this segregating population on chromosome 7H. In L94 × C123, two QTLs for resistance were mapped, one each on chromosomes 7H and 2H.Key words: QTLs, leaf stripe, Pyrenophora graminea, composite interval mapping, barley.La strie foliaire, causée par le Pyrenophora graminea, est une maladie transmise via les graines chez l'orge et peu de choses sont connues au sujet de la génétique de la résistance à ce pathogène. Dans ce travail, une analyse QTL a été réalisée sur deux populations de lignées recombinantes fixées (RIL) dérivées de croisements entre génotypes d'orge à deux ou six rangs et présentant divers niveaux de résistance partielle à la strie foliaire. Des QTL associés à une résistance partielle ont été identifiés à l'aide de la méthode de cartographie d'intervalles composites (CIM) et du logiciel PLABQTL en prenant les marqueurs QTL putatifs comme cofacteurs. Dans la population de cartographie L94 × 'Vada', un QTL pour la résistance a été détecté sur le chromosome 2H. Il s'agit du même locus où a été précédemment localisé le gène Rdg1 chez 'Alf', un gène qui confère une résistance complète au pathogène. Un autre QTL à effet mineur a été détecté sur le chromosome 7H à la suite d'analyses ultérieures au sein de cette même population. Dans le croisement L94 × C123, deux QTL pour la résistance ont été décelés sur les chromosomes 7H et 2H respectivement.Mots clés : QTL, strie foliaire, Pyrenophora graminea, cartographie d'intervalles composites.[Traduit par la Rédaction]
ACCESSION #
10579486

 

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